我国发布首款自主知识产权番茄育种基因芯片“京番芯1.0”，涵盖近5000个位点，检测成本低于进口

番茄原产于南美洲地区，明朝经丝绸之路引入中国，最初仅作观赏植物栽培，新中国成立后才大规模种植食用。如今，番茄已成为中国设施蔬菜的重要作物。行业数据显示，中国番茄总产量自20世纪90年代中期超越美国以来，一直居世界第一位。当前，中国番茄播种面积基本保持在1600万亩左右，总产量约6100万吨，产值约1800亿元。在正常收获情况下，番茄亩均收益是土豆的6倍、甘蓝的8倍、玉米的18倍。

由于番茄为非本土作物，大规模种植食用时间短，系统性育种工作起步较晚，中国番茄种质资源和种质精准鉴定、定向改良的核心工具长期依赖外部。育种成本高、国产化工具不足，制约了番茄种业发展。例如，法国串收番茄品种“Saopolo”一粒种子售价18元至20元，一亩地需2000粒至3000粒种子。一些育种企业尤其是中小育种单位开展分子辅助育种时，面临检测成本高、进口芯片适配性差、部分数据和技术受制于外部的困境，导致许多优异地方番茄种质资源的遗传价值难以被充分挖掘。

近日，中国首款具有完全自主知识产权的高精度番茄育种固相基因芯片“京番芯1.0”发布。该芯片涵盖醋栗番茄、樱桃番茄及栽培种等丰富遗传背景，包含近5000个核心位点，位点在番茄染色体上均匀分布，覆盖产量、品质、抗病虫、抗逆等重要农艺性状。经检测，芯片检出率达99.12%，检测重复性达99.85%。该芯片基于中国自身番茄种质群体开展位点挖掘，更适配本土育种材料，可显著提高种质资源精准鉴定和育种选择效率，快速筛选优良基因型，加速优质番茄品种研发进程。

固相基因芯片可用于分子标记辅助育种，帮助育种人员快速筛选种质资源材料，缩短育种周期，提升研发效率；也可用于种子质量管控，快速检测种子真实性与纯度，区分不同品种，为种苗提供质量保障；还可用于品种登记与维权打假，为政府监管提供快速、准确的证据支持，有效保护品种权，打击“仿种子”。相较于液相基因芯片需2周左右的测序与分析流程，固相基因芯片从实验到下机出结果仅需3天，可极大缩短育种窗口期。同时，“京番芯1.0”检测成本显著低于市场上现有的液相基因芯片及同类进口固相基因芯片，可降低育种工作者负担。